Kilise birkaç mimari yapının bir araya getirilmesiyle oluşturulmuştur: ön cephedeki çift merdiven Carbonara'daki Teselli Kilisesi'nin girişini gizlemektedir; ortadaki portal Aziz Monica Şapeli'ne, soldaki ise Aziz John Kilisesi'nin yan girişine açılmaktadır.Şehirdeki en zengin kiliselerden biridir.Bu güzel kilise, 1339 ve 1343 yılları arasında 'ad carbonetum' olarak adlandırılan şehir surlarının dışındaki araziyi Augustinian Pederlerine bağışlayarak manastırı ve kiliseyi kurmalarını sağlayan soylu Gualtiero Galeota sayesinde inşa edilmiştir (Via Carbonara, Orta Çağ'da şehir surlarının dışında çöplerin toplandığı bir yer olduğu için hala bu şekilde adlandırılmaktadır).Durazzo Kralı Ladislaus'un Napoli'ye gelişiyle birlikte kilisenin tamamen yeniden inşasına başlanmış ve sonraki yüzyıllarda yapılan bazı değişiklikler ve eklemeler dışında kilise bugünkü görünümünü almıştır. Kilisenin önemli girişi kilisenin önemi hakkında bir fikir vermektedir: 18. yüzyılda Ferdinando Sanfelice tarafından inşa edilen anıtsal bir merdivenle ulaşılan bu merdiven, cadde ile karmaşık mimari yapıyı oluşturan binaların çeşitli girişleri arasındaki yükseklik farkları sorununu çözmek için çift kat merdiven oluşturmuştur.Tüm kompleks, Santa Monica Kilisesi ve Carbonara'daki Teselli Kilisesi olmak üzere iki ibadet binasını daha içermektedir; ayrıca yakınlarda Carbonara'daki Pietatella Kilisesi adında bir kilise daha bulunmaktadır. Dikdörtgen bir plan üzerine inşa edilen anıtsal San Giovanni a Carbonara kilisesinin içinde, 1414-1428 yılları arasında inşa edilen ve alegorik figürlerle zengin bir şekilde dekore edilen Kral Ladislaus'un anıt mezarı bulunmaktadır.Anıtın arkasında, büyük siniscalco ve Kraliçe Giovanna'nın sevgilisi Sergianni Caracciolo'nun anıtının bulunduğu Caracciolo del Sole Şapeli yer almaktadır. Miroballo, Somma ve Caracciolo di Vico ailelerine ait olanlar gibi diğer şapeller de heykeller ve önemli mezar anıtları bakımından zengindir. Duvarlarda Giotto'nun okulundan manastır yaşamı ve Bakire'nin doğumu sahnelerini tasvir eden freskler yer almaktadır. Presbiteryumun sağında Caracciolo di Vico Şapeli, kutsal alan, Madonna delle Grazie sunağı ve Miroballo mezar anıtı yer almaktadır.Kilisede ayrıca Giorgio Vasari'nin kilise kutsal alanı için yaptığı on altı eser de yer almaktadır. Pano resimleri 1545 yılında Augustinian Tarikatı tarafından sipariş edilmiş ve Vasari tarafından 1546 yılında en yetenekli ortaklarından Cristofano Gherardi'nin işbirliğiyle gerçekleştirilmiştir. Bunlar, Eski Ahit'ten Öyküler ve Vaftizci Yahya'nın Yaşamından Bölümler'i tasvir eden, kutsal dolapların kapılarını süsleyen panel üzerine yapılmış 16 tablodan oluşuyordu. Bu güzel eserler titiz bir restorasyondan geçirilmiş ve Capodimonte'de de sergilenmiştir.
