Kirik on mitme arhitektuurse struktuuri liitmise tulemus: fassaadi kahekordne trepikoda varjab sissepääsu selle all asuvasse Carbonara lohutuskirikusse; keskne portaal viib Püha Monica kabelisse, vasakul asuv portaal Püha Johannese kiriku külgmise sissepääsu juurde.See on üks linna rikkamaid kirikuid.Kaunis kirik ehitati tänu aadlikule Gualtiero Galeota, kes aastatel 1339-1343 annetas augustiinlaste isadele väljaspool linnamüüre asuva maa, mida nimetatakse "ad carbonetum", võimaldades neil kloostri ja kiriku rajada (Via Carbonarat nimetatakse endiselt nii, sest keskajal oli see väljaspool linnamüüre asuv prügikogumispaik).Durazzo kuninga Ladislaus Durazzo saabumisega Napoli algas kiriku täielik ümberehitamine, mis omandas oma praeguse välimuse, välja arvatud mõned muudatused ja täiendused järgnevatel sajanditel. Kiriku tähtsusest annab aimu oluline sissepääs: sinna pääseb 18. sajandil Ferdinando Sanfelice poolt ehitatud monumentaalse trepi kaudu, kes lõi kahekordse trepi, et lahendada tänava ja keerulise arhitektuurse struktuuri moodustavate hoonete erinevate sissepääsude vaheliste kõrguserinevuste probleem.Kogu kompleksi kuuluvad veel kaks pühakoda, milleks on Santa Monica kirik ja Carbonara lohutuskirik; lähedal on veel üks kirik, Pietatella kirik Carbonaras. San Giovanni a Carbonara monumentaalse kiriku sees, mis on ehitatud ristkülikukujulisel plaanil, asub kuningas Ladislause mausoleum, mis on ehitatud aastatel 1414-1428 ja kaunistatud rikkalikult allegooriliste figuuridega.Monumendi taga asub Caracciolo del Sole kabel, kus on Sergianni Caracciolo, suure siniscalco ja kuninganna Giovanna armastaja mälestusmärk. Teised kabelid, näiteks Miroballo, Somma ja Caracciolo di Vico perekondade kabelid, on rikkalikult varustatud kujude ja tähtsate hauamonumentidega. Seintel on Giotto koolkonna freskod, millel on kujutatud stseene kloostrielust ja Neitsi Maarja sünnist. Presbüteriumist paremal on Caracciolo di Vico kabel, sakristo, Madonna delle Grazie altar ja Miroballo matuse mälestusmärk.Kirikusse kuulus ka kuusteist Giorgio Vasari tööd, mis on loodud kiriku sakristiiri jaoks. Tahvlimaalid telliti 1545. aastal Augustinlaste ordu poolt ja Vasari teostas need 1546. aastal koostöös Cristofano Gherardiga, kes oli üks tema andekamaid kaastöötajaid. Need olid 16 tahvlimaalid, mis kaunistasid sakristi kappide uksi ja kujutasid lugusid Vanast Testamendist ja episoode Ristija Johannese elust. Need kaunid tööd läbisid põhjaliku restaureerimise ja neid eksponeeriti ka Capodimontes.
