Maltako hiriburuan egonaldia ez da erabatekoa San Joanen Maltako Katedrala bisitatu gabe. Proiektua 1572an Jean de la Cassiere Maisu Handiak enkargatu zuen San Joan Zaldunen Ordenaren eliza izateko, eta Gerolamo Cassar arkitekto Maltarrak diseinatu zuen. Obra 1577rako amaitu zen eta San Joan Bataiatzaileari eskaini zioten, Ordenako bi zaindarietako bati. Vallettako San Joan Katedralak Malta herrialderako kristautasunak duen garrantzia erakusten du. Kanpotik begiratuta, XVI. mendeko katedral honek ez du itxura handirik, baina begiratu barrura eta benetako sorpresa bat izango duzu. Katedrala XVII. mendean berritu zuten eta dekorazio barroko oparoa du. Bere arte barroko aberatsa eta erlikia ez ezik, Ko Katedralak fresko barroko ikusgarriak, marmolezko zoru apainduak, hiru dimentsioko estatuak, landutako harrizko hormak eta Mattia Preti artista barroko italiar ezagunak apaintzen dituen ganga-sabai zoragarriak ere gordetzen ditu. Kokatedralean ere Michelangelo Merisi da Caravaggioren nazioartean ezagunenetako bat dago, ‘San Joan Bataiatzailearen burua moztea’ (1608). Margolana, Oratorio barruan kokatua, Caravaggioren artelan handiena da eta bere sinadura daraman bakarra. Urteko egun guztietan, bisitariak katedralera joaten dira artelan ospetsua ikusteko, eta asko katedralera itzuliko dira uhartean dauden bakoitzean. Katedrala bera alboetan ospe handiz apaindutako bederatzi kaperaz osatuta dago; zortzi Donibaneko Zaldunen hizkuntza bakoitzerako eraiki ziren, eta bederatzigarrena haien patroiari, Filermoko Andre Mariari, Ordenako beste zaindariari eskainia dago. Azken kaperan Filermoko andrearen antzinako ikono bat ere dago, Zaldunek objektu sakratutzat hartzen zutena. San Joaneko Katedralak Maltako San Joaneko Zaldunen iraganeko Maisu Handien hilobiak dituen kripta misteriotsu bat ere gordetzen du.
