Ne tokia turistinė San Klemento al Laterano bazilika pasakoja Romos istoriją pagal skirtingus bažnyčios sluoksnius. Dabartinė bažnyčia "San Clemente", dedikuota popiežiui Klemensui I, XII a. buvo pastatyta ant IV a. bažnyčios. Po ja rasta daug daugiau romėnų pamatų. Dabartinė bazilika yra viena iš daugelio Romoje ir nėra pagrindinė jūsų apsilankymo priežastis, tačiau 20 metrų žemiau šios bažnyčios rasta romėnų namų (500-27 m. pr. m. e.) liekanų. Manoma, kad namus sunaikino didelis gaisras imperatoriaus Nerono valdymo metu, o vėliau jie buvo panaudoti kaip pamatai.
Ant šių pamatų rastas dar vienas didelis namas, kuris buvo pastatytas I amžiuje. Šis namas tuo metu popiežiui Klemensui tarnavo kaip slapta bažnyčia, nes dar nebuvo religijos laisvės.
IV a., kai buvo suteikta religijos laisvė, ant slaptosios bažnyčios buvo pastatyta bazilika. Bažnyčia buvo skirta šventojo Klemenso, trečiojo popiežiaus Petro įpėdinio, kapui. Ši bazilika unikali tuo, kaip gausiai ją puošė dailininkai ir skulptoriai.
1084 m. per vikingų antpuolius didžioji bažnyčios dalis buvo sugriauta, po to XII a. popiežius Paskalis liepė ant senosios bažnyčios pastatyti naują. Siekiant sukurti tvirtus pamatus, dalis senosios bažnyčios buvo užmūryta ir užpilta.
Nuo 1862 m. buvo atlikta daug kasinėjimų, kurių metu buvo atidengtos senovinės apatinės bažnyčios konstrukcijos, mozaikos ir freskos. Lankydamiesi bažnyčioje keliaujate per įvairius jos istorijos sluoksnius.
