Ši įspūdinga bažnyčia, iškilusi virš Parte Vieja, laikoma seniausiu San Sebastiano pastatu. Jos ištakos siekia XII a., tačiau dabartinę gotikinę formą ji įgavo 1500 m. pradžioje. Jos interjere yra labai gražus romėniškas altoriaus paveikslas, Ambrosio de Bengoechea ir Juano de Iriarte darbas. Dėmesio centre yra 1868 m. prancūzų vargonai, kuriuos sukūrė Cavaille-Coll, ir įspūdingi vitražai. Vienoje fasado pusėje stovi menininko Jorge Oteizos "Pietos" skulptūra. San Vikentėje pakrikštyti žmonės dėl iš bažnyčios kyšančių akmenų (baskų kalba - koxka) vadinami "koxkeros".