Parte Vieja'nın üzerinde yer alan bu çarpıcı kilisenin San Sebastián'ın en eski binası olduğu düşünülmektedir. Kökeni 12. yüzyıla kadar uzanmaktadır ancak 1500'lü yılların başında bugünkü Gotik formunda yeniden inşa edilmiştir. Kilisenin iç kısmında Ambrosio de Bengoechea ve Juan de Iriarte'nin eseri olan çok güzel bir Romanesk sunak yer almaktadır. Cavaille-Coll'un 1868 tarihli Fransız orgu ve etkileyici vitray pencereler ilgi odağıdır. Cephenin bir tarafında sanatçı Jorge Oteiza'nın "Pietà" heykeli yer almaktadır. San Vicente'de vaftiz edilenler, kiliseden çıkıntı yapan taşlar nedeniyle "koxkeros" (Bask dilinde koxka) olarak bilinmektedir.
