St. Nikolai-Kirche (St. Nicholas ' Kirke) er den ældste kirke i Berlin. Området omkring kirken er kendt som 'Nicholas-kvarteret' og er et område med restaurerede middelalderlige bygninger. Kirken blev bygget mellem 1220 og 1230 og er således sammen med Vor Frue Kirke ikke langt væk den ældste kirke i Berlin.
Oprindeligt en romersk-katolsk kirke blev St. Nicholas Kirke en luthersk kirke efter protestantisk Reformation i Vælgerne i Brandenburg i 1539. I det 17.århundrede var den fremtrædende salmeforfatter Paul Gerhardt minister for denne kirke, og komponisten Johann Crueger var musikalsk direktør. Den fremtrædende lutherske teolog Provost Philipp Jacob Spener var minister fra 1691 til 1705. Fra 1913 til 1923 var ministeren ved St. Nicholas Kirke Vilhelm vessel, hvis søn Horst vessel senere blev berømt som en fascist: familien boede i den nærliggende J.
På Reformationsdagen i 1938 tjente kirkebygningen sin menighed for sidste gang. Derefter blev bygningen, den ældste struktur i selve Berlin, givet op til regeringen, der skulle bruges som en koncertsal og kirkeligt museum. Antallet af sognebørn var faldet på grund af den stadigt intensiverede kommercialisering af den indre by med boliger, der blev afløst af kontorer og butikker. Menigheden fusionerede senere med Vor Frue Kirke.
Under Anden verdenskrig mistede kirken St. Nicholas ved ild toppen af sine tårne og taget som følge af allieret bombning. I 1949 kollapsede alle hvælvingerne og de nordlige søjler. Ruinerne var i Østberlin, og det var først i 1981, at de østtyske Demokratiske Republik myndigheder godkendte genopbygningen af kirken ved hjælp af gamle designs og planer. Kirken St. Nicholas som set i dag er stort set en rekonstruktion. I dag fungerer kirken igen hovedsageligt som museum og lejlighedsvis som et koncertsted, administreret af Stiftung Stadtmuseum Berlin (Landesmuseum for Kultur og Geschichte Berlins). Det er kendt for sin akustik, og den genopbyggede kirke er udstyret med et fint sæt på 41 klokker.
