Sant 'eustorgio bazilikas muzejs, kas kopā ar sant' eustorgio baziliku un Museo Diocesano Carlo Maria Martini ir daļa no Sant ' eustorgio klosteru kompleksa, sastāv no nozīmīgiem monumentāliem, vēsturiskiem un mākslinieciskiem piemēriem, kas ir ļoti atšķirīgi no tiem, bet būtiski svarīgi Milānas kontekstā, sākot no agrīnās kristiešu kapsētas, kas atrodas zem baznīcas nave, kur starp 1959 un 1962 tika atrastas nekropoles paliekas no vēlu senatnes perioda.
Muzeja daļa ir arī divas nodaļas nama monumentālās telpas un monumentālā sakristeja, caur kuru var piekļūt Portinari kapelai. Pēdējais, lombarda renesanses arhitektūras meistardarbs, tika uzcelts no aptuveni 1462. līdz 1468. gadam Pigello Portinari komisijā, ir būtiska liecība par Toskānas matricas renesanses valodas pirmsākumiem, kas uzpotēti lombarda kultūrā.
Liels atvieglojums uzņemas bagātīgo plastmasas apdari, galvenokārt terakotā, kas dialogā ar Vincenzo Foppa lieliskajām freskām, kas veltītas Svētā Pētera mocekļa stāstiem. Kapelas centrā ir Svētā Pētera mocekļa šķirsts, kas liecināja par gotisko skulptūru, ko Giovanni Di Balduccio izgatavoja no 1336.līdz 1339. gadam.
