A Santa Mar-bazilika azon a helyen található, ahol a muszlim korszakban a fő mecset található. Miután I. Jaume 1265-ben meghódította a várost, a mecset 1334-ig ezen a helyen maradt. Tetején épült az első katolikus templom, valószínűleg gótikus stílusban, kereszt elrendezéssel, amely 1492-ig maradt fenn.
Úgy gondolják,hogy ebben a templomban a Misteri-t (Elche Rejtélyjátékát) először adták elő, valószínűleg rámpák, padlólapok és magas mennyezet felépítésével, kupola, kupola vagy boltív formájában, amint az az akkori Nagyboldogasszony-előadások normája volt.
A második templom nagyobb volt, 1556-ban készült el, de 1672-ben a heves esőzések miatt összeomlott. Megtartjuk Christopher Sanz 1621-es leírását: "a templom, ahol ezt a fesztivált tartják, amely a fő templom, úgy tűnik, hogy éppen erre a célra épült, hatalmas mérete miatt, olyan magas hajóval, hogy félelmet és csodálkozást vált ki a kívülállókban. Úgy tűnik, hogy a Szűzanya maga tartja fel, hogy ott a saját halálát és mennybemenetelét ünnepeljék. Az egész kereszténységben nincs még egy ilyen épület, mint ez az egyház, amely 1556-ban készült el, amint az épületeiben látható".
A jelenlegi templom építése 1672-ben kezdődött Francesc Verde építőmester parancsára, aki átvette a szerepet Pere Quintana-tól és Ferr Fouquet-tól. 1758-tól Marcos Evangelio építész jelentős hozzájárulással folytatta az építkezést. A munkálatok véglegesen 1784-ben fejeződtek be.
Elrendezése Latin kereszt alakú, nagy központi hajóval, mindkét oldalán négy kápolnával, perforált támpillérekkel. A kereszthajó felett egy nagy kupola található, amely az Elche Rejtélyjátékának részét képezi, amelyet kívülről kék csempék borítanak.
Nyomon lehet követni a különböző építészeti stílusokat, a díszítetlen stílus javításának első erőfeszítéseitől kezdve a tiszta neoklasszikusig, áthaladva a Nagyboldogasszony fa-évszámának dekoratív olasz Barokkján, amely a Valenciai barokk egyik legszebb példája. Mind a homlokzat, mind a San Agat főbejárata a strasbourgi szobrász alkotásai Nicol ons de Bussi (1680-1682).
