Ang pinakamahalagang bahagi ng Kumbento at ang Simbahan ng mga Capuchins ay ang pinagbabatayan na crypt, na kung saan ay ginawang tanyag ang bayan ng Savoca. Ito ay itinayo sa ibaba ng Simbahan at ang nakaharap na parisukat sa simula ng 1600s. Sa loob ay mayroong 37 mummies. Ang una ay itinayo noong 1776, ng marangal na Pietro Salvadore, at ang huli noong 1876, ang kay Giuseppe Trischitta. Tulad ng para sa Capuchin Convent ng Palermo, ang mga mummy ay kabilang sa aristokrasya ng Savoca, tulad ng, halimbawa, mga marangal na patrician, abogado, pari, monghe, abbot, doktor, makata, mahistrado at tatlong bata. Dahil ang mga mummy, sa pagtatapos ng proseso ng pag-embalsamo, ay nakasuot ng mga eleganteng damit, sa mga niches at kabaong na naglalaman ng mga ito, isang maliit na nayon ng panahon ang lumitaw sa amin, halos tulad ng isang larawan: ang Savoca noong unang panahon.Sa 37 mummies, 17 ang naka-display sa kahabaan ng dingding ng crypt, na nakapaloob sa mga niches, ang iba ay nakalagay sa mga urn at coffins, gayundin sa basement. Mayroon ding altar, marahil para sa pagdiriwang ng mga misa sa pagboto.Tumagal ng humigit-kumulang animnapung araw upang "makabuo" ng isang mummy at ang proseso ng mummification ay katulad sa halos lahat ng Sicily. Ito ay isang paraan na tinatawag na natural na pagpapatayo. Sa una, ang katawan ay sumailalim sa dalawang araw na paliguan sa isang pagbabanto ng asin at suka. Matapos maghintay na maubos ang mga bituka, dinala ito sa crypt, kung saan naganap ang "natural" na pagpapatayo, salamat sa mga agos ng hangin na tipikal ng kapaligiran. Nang makuha ang mummy, nagbihis ito ng damit at taimtim na ipinakita sa loob ng crypt.Ang mummification na iyon ay naging isang uri ng fashion sa Sicilian ikalabinsiyam na siglo ay ipinakita sa pamamagitan ng pagkakaroon sa Savoca mismo (at sa natitirang bahagi ng Sicily, gaya ng makikita natin) ng iba pang mga crypts at iba pang mga mummies, tulad ng sa Mother Church of Santa Maria sa Cielo Assunta, na itinayo noong 1130 at ngayon ay isang pambansang monumento ng Italya, kung saan pinananatili ang iba pang mga katawan ng mga kilalang tao ng bayan.Noong 1998, sa panahon ng mga gawaing pagpapanumbalik ng Church of the Immaculate Conception na nahulog sa pagkawasak (upang magamit bilang isang municipal philharmonic center), ang sinaunang crypt ay natagpuan sa ilalim ng sahig ng templo, kung saan ang mga prayle ng Convent of the Friars. Ang mga menor de edad ay inilibing na mga Pransiskano at ang mga naninirahan mismo sa distrito ng San Rocco.