Kaputsiinide kloostri ja kiriku kõige tähtsam osa on allpool asuv krüpt, mis on teinud Savoca linna kuulsaks. See ehitati 17. sajandi alguses kiriku ja selle kohal asuva väikese väljaku alla. Sees on 37 muumiat. Esimene pärineb 1776. aastast, aadlimees Pietro Salvadore oma, ja viimane 1876. aastast, Giuseppe Trischitta oma. Nagu ka Palermo kaputsiinide kloostri puhul, kuuluvad muumiad Savoca aristokraatiasse, nagu näiteks aadlikud patriitsid, advokaadid, preestrid, mungad, abtid, arstid, luuletajad, kohtunikud ja kolm last. Kui muumiad balsameerimisprotsessi lõpus elegantsetesse rõivastesse riietatud, ilmub neid sisaldavates niššides ja kirstudes, peaaegu nagu fotol, mineviku väikelinn: kunagine Savoca. 37 muumiast 17 on eksponeeritud piki krüptoloogia ühte seina, mis asuvad niššides, teisi hoitakse urnides ja kirstudes, samuti keldris. Seal on ka altar, ilmselt valimismismissa pidamiseks. Muumia "tootmiseks" kulus umbes kuuskümmend päeva ja mumifitseerimisprotsess oli sarnane peaaegu kogu Sitsiilias. See oli meetod, mida nimetatakse loomulikuks kuivatamiseks. Esialgu vannitati surnukeha kaks päeva soola ja äädika lahuses. Pärast sisikonna kuivamise ootamist viidi see krüptasse, kus toimus "loomulik kuivamine" tänu keskkonna õhuvoolule. Kui muumia oli kätte saadud, riietati see oma riietesse ja pidulikult eksponeeriti kripti sees.
Seda, et mumifitseerimine oli 19. sajandi Sitsiilias muutunud moodi, näitab see, et Savocas endas (ja mujal Sitsiilias, nagu me veel näeme) on ka teisi kruupe ja muid muumiaid, näiteks 1130. aastal ehitatud Santa Maria in Cielo Assunta emakirikus, mis on nüüd Itaalia riiklik monument ja mille sees on säilitatud teisi linna tuntud isikute surnukehi. 1998. aastal avastati templi põranda alt lagunenud (munitsipaalfilharmoonia keskusena kasutatava) Immaculata Kontseptsiooni kiriku restaureerimistööde käigus iidne krüpt, kuhu olid maetud frantsiskaani vennastekloostri mungad ja San Rocco linnaosa elanikud ise.