Historia e Grotte di Nettuno daton në kohët parahistorike. Disa gjurmë, që i përkasin neolitit, të gjetura brenda tyre, sugjerojnë se kanë kaluar rreth 2 000 000 vjet nga formimi i tij. Është pothuajse e sigurt që njerëzit primitivë i njihnin dhe i përdornin sipas nevojave të tyre.Shpellat e Neptunit nuk janë vetëm më të famshmet, por edhe më të mëdhatë. Ato shtrihen për rreth 4 km, por për arsye sigurie turistët mund të aksesojnë vetëm një pjesë të tyre. Përveç përfaqësimit të një destinacioni të rëndësishëm turistik dhe mikpritjes së vizitorëve nga e gjithë bota, Grotte di Nettuno janë gjithashtu një destinacion tërheqës i madh për speleologët, të vetmit që mund të vizitojnë luginat më sekrete.
