Napjainkban a Brno városi múzeum az ország legjobb múzeumai közé tartozik, a város számos történelmi, ikonikus épületében található: Špilberk kastélyban, Měnínská bránában (a Měnín kapu), valamint a Villa Tugendhatban. Špilberk a központi helyszín, mivel otthont ad a múzeum adminisztrációjának, könyvtárainak, fotóarchívumának, valamint a legtöbb szakember alkalmazottjának. A Várbazár raktárként és állandó kiállítóhelyként, valamint egyéb, főként Brno történelmével és kultúrájával kapcsolatos kiállítóhelyként szolgál. A Brno városi múzeum a Villa Tugendhatot is kezeli, amely az UNESCO Világörökség részét képező modern építészet egyik fő példája.