Šiuo metu Brno miesto muziejus užima tarp geriausių šalies muziejų ir yra įsikūręs keliuose miesto istoriniuose, ikoniniuose pastatuose: Špilberko pilyje, Měnínská brána (Měnín vartai) ir viloje Tugendhat. Špilberkas yra centrinė vieta, nes jame yra muziejaus administracija, bibliotekos, nuotraukų archyvas ir dauguma specialistų darbuotojų. Pilies patalpos tarnauja kaip depozitoriumas ir vieta nuolatinėms parodoms, taip pat kitoms parodoms, daugiausia susijusioms su Brno istorija ir kultūra. Brno miesto muziejus taip pat administruoja vilą Tugendhat, pagrindinį šiuolaikinės architektūros pavyzdį, įtrauktą į UNESCO Pasaulio paveldo sąrašą.