St. Nikolai-Kirche, (St.Nicholas kyrka) är den äldsta kyrkan i Berlin. Området runt kyrkan är känt som 'Nicholas quarter', och är ett område med restaurerade medeltida byggnader. Kyrkan byggdes mellan 1220 och 1230 och är således, tillsammans med Our Lady of Our Lady på Alexanderplatz inte långt borta, den äldsta kyrkan i Berlin.
Ursprungligen en romersk-katolsk kyrka, Kyrkan St. Nicholas blev en luthersk kyrka efter protestantisk Reformation i väljarna i Brandenburg 1539. På 17-talet var den framstående psalmförfattaren Paul Gerhardt minister för denna kyrka, och kompositören Johann Crueger var musikalisk regissör. Den framstående lutherska teologen Provost Philipp Jacob Spener var minister från 1691 till 1705. Från 1913 till 1923 var ministern vid kyrkan St.Nicholas Wilhelm Wessel, vars son Horst Wessel senare blev känd som nazist: familjen bodde i den närliggande J.
På Reformationsdagen 1938 tjänade kyrkobyggnaden sin församling för sista gången. Sedan gavs byggnaden, den äldsta strukturen i Berlin, till regeringen för att användas som konsertsal och kyrkmuseum. Antalet församlingsbor hade krympt på grund av den ständigt intensifierade kommersialiseringen av innerstaden med bostadslokaler som ersattes av kontor och butiker. Församlingen slogs senare samman med Vår Frus kyrka.
Under andra världskriget förlorade kyrkan St. Nicholas i eld toppen av sina torn och taket som ett resultat av allierad bombning. 1949 kollapsade alla valv och de norra pelarna. Ruinerna var i Östberlin, och det var först 1981 som de östtyska Demokratiska Republikens myndigheter godkände återuppbyggnaden av kyrkan med hjälp av gamla mönster och planer. Kyrkan St. Nicholas som ses idag är till stor del en rekonstruktion. Idag fungerar kyrkan igen främst som ett museum och ibland som en konsertlokal, administrerad av Stiftung Stadtmuseum Berlin (Landesmuseum F 0 Kultur und Geschichte Berlins). Det är känt för sin akustik och den ombyggda kyrkan har utrustats med en fin uppsättning av 41 klockor.
