Štátne múzeum San Marína vzniklo v druhej polovici devätnásteho storočia po sérii darov zo všetkých častí sveta kvôli mnohým obdivovateľom republiky a spočiatku ho propagoval gróf Luigi Cibrario, minister Vittorio Emanuele II. a splnomocnenec štátu san Maríno od prvej zmluvy s talianskym kráľovstvom (1862).
Bol slávnostne otvorený v roku 1899 v Palazzo Valloni, sídle vládnej knižnice. Autonómna v roku 1982 bola reorganizovaná v starom Palazzo Pergami Belluzzi, primerane zrekonštruovaná a znovu otvorená pre verejnosť 18. marca 2001.
Má historické a umelecké materiály (takmer 5000 kusov) niektoré zo San Marína a relevantné pre jeho históriu, a iné rôzneho pôvodu, kvôli nákupom, ako aj darom poskytnutým štátu od roku 1865 do súčasnosti.