Finland var en del av Sverige fram till 1809, och den finska kyrkans nationalförsamling grundades i Stockholm 1533, vid den tiden inrymt i Blackfriars gamla kloster. En byggnad byggd på den nuvarande platsen 1648-1653, ursprungligen avsedd för bollspel, och därmed kallad Lilla bollhuset, men mest används som teater, togs över av den Finska församlingen 1725 från när den oregelbundet formade byggnaden stammar. I inredningen liknar orgelloftet fortfarande galleriet i det gamla Bollhuset. Eftersom kyrkan aldrig hade en medföljande kyrkogård, var Katarina kyrka på Södermalm av stor betydelse för den Finska församlingen fram till 1800-talet.