Franciska bazilika tika uzcelta brāļa Eliasa, ģenerālvikāra un ordeņa arhitekta vadībā, sākot ar 1228.gadu, tikai divus gadus pēc Svētā nāves, kā vietu, kas paredzēta viņa mirstīgo atlieku uzņemšanai. Pāvests Gregorijs IX uzlika pirmo akmeni 1228.gada 17. Jūlijā, nākamajā dienā pēc Svētā Franciska kanonizācijas, vietā, kas iepriekš tika izmantota noziedznieku nāvessodiem un apbedījumiem. Saskaņā ar tradīciju pats Francisks uz nāves gultas norādīja šo vietu saviem pavadoņiem kā apbedīšanas vietu. Ārpuse Bazilikas ārpusei ir acīmredzamas atsauces uz franču gotiku planējošajā fasādē un divpusējās durvīs, ko atvieglo horizontālās kronšteini un rožu logs ar tipisku Umbrijas izskatu un ar smagu, plaši strukturētu zvanu torni. Virsmas ir visas akmens no Mt. Subasio, kas dienas laikā ir rozā krāsā un mēness gaismā spīd baltā krāsā. Apakšējā baznīca Apmeklētāji ieiet apakšējā bazilikā no sāniem, izmantojot dubultu 13. c. durvju aile, kuru pārspēj renesanses protirums. Interjerā ir viena Nava, kas sadalīta piecos līčos ar zemām pasāžām, ar sānu kapelām no 13.gadsimta beigām. Pirmajā līcī, pie ieejas, tiek parādīti divi lieli 14. c. gotikas kapenes, un starp tām-kancele ar 13. C.bāzi, ar aizmugurējiem papildinājumiem un pārstrādi. Pretī ieejai atrodas Svētās Katrīnas jeb krucifiksa kapela, kas dekorēta ar Boloņas Andrea Bartoli (1368) fresku ciklu un izgaismota ar mullioned 14. C.logi. Polihroms koka krucifikss uz altāra datēts ar piecpadsmitā gadsimta beigām. Navas sienās ir fresku paliekas ar ainām no Kristus kaislības (pa labi) un stāstiem no Svētā Franciska dzīves (pa kreisi), ko veidojis tā sauktais Svētā Franciska meistars (ap 1253.gadu). Netālu no kreisās sienas gala, nišā virs gotikas dais, ir freska no Jaunavas kronēšana pēc Pučio Kapanna (14. gs.). Navas vidū kāpnes ved uz kriptu; aiz altāra atrodas urna, kurā atrodas Svētā mirstīgās atliekas, ko aizsargā dzelzs režģis. Atgriežoties baznīcā, Magdalēnas kapela saglabā dārgās freskas (apmēram no 1314.gada), kurās attēloti Marijas Magdalēnas un Svēto stāsti, kas attiecināti uz Džoto skolu, un, iespējams, iekļaujot kādu gleznu ar meistara roku. Pirmā kapela kreisajā pusē parāda epizodes no Svētā Martina dzīve, autors Simone Martini (1312-1320). Velves krustojumā, virs gotiskā altāra, ir citas freskas, kas piedēvētas Džoto palīgiem, ieskaitot Maestro delle Vele (Asīzes velvju meistars). Labās transeptas sienas un mucas velve saglabā Džoto skolas freskas un Madonnu, kas Tronēta ar Eņģeļiem un Svēto Francisku, lielisku Cimabue kompozīciju, kas ir daļēji samazināta. Uz kaimiņu sienas beigās ir piecas svēto figūras, kas attiecinātas uz Simone Martini. Nikolaja kapela ir dekorēta ar freskām no Giotto skolas (no 1300.līdz 1310. gadam), iespējams, izpildīta ar paša meistara palīdzību un pārstāvot šī svētā stāstus. Nišā virs altāra atrodas nezināma Umbrijas meistara Džovanni Gaetano Orsini Gotiskais kaps. Uz sienām un kreisā transepta velvēm apmeklētāji var apbrīnot Pietro Lorenzetti un viņa darbnīcas (1315-20) Kristus kaislības un Madonnas un Svēto ciklu, kā arī citas gleznas. Augšējā baznīca Ja svinīgā un tumšā apakšējā bazilika aicina gavēni un klusumu, augšējā baznīca paceļas debesīs, gaisīga un gaiša. Gotikas stilā ar franču ietekmēm navā ir četri Līči, krosa velve un daudzstūra šķērsgriezums un apse. Transeptu lieliski rotā Cimabue freskas ar slaveno krustā sišanu, Apokalipses ainām un Svētā Pētera stāstiem. Sākot ar 1277.gadu, ciklu ir sabojājušas izmaiņas, kurās baltā krāsa ir ieguvusi tumšu toni, piešķirot dažiem attēliem fotogrāfisku negatīvu izskatu. Cimabue un viņa palīgi arī krāsoja četrus Evaņģēlistus uz griestiem virs gotiskā lielā altāra un freskām ar Marijas stāstiem uz sienām. Navas augšējā daļā ir fresku cikls ar jaunās un Vecās Derības stāstiem, kas, domājams, daļēji ir Romas skolas gleznotāju darbs un daļēji Cimabue sekotāji. Stāstījuma ainu telpa mijas ar logiem, kas rotāti ar viduslaiku vitrāžām, kas, neskatoties uz rekonstrukciju, veido vienu no pilnīgākajiem šādiem komplektiem Itālijā. Nave sienu apakšējā daļa ir dekorēta ar slaveno fresku ciklu, ko izstrādājis Giotto, kurš uzraudzīja tā pabeigšanu ar citām rokām. Ciklā ir ainas no Svētā Franciska dzīves, sākot no jaunības līdz nāvei un līdz pēcnāves brīnumiem, kas viņam piedēvēti, ierāmēti ar krāsotu arhitektūru, kurā attēlotas kolonnas un iekavas.