Buvimas Maltos sostinėje neapsieina be apsilankymo Šv. Jono riterių ordino bažnyčią 1572 m. užsakė didysis magistras Jeanas de la Cassiere'as, o ją suprojektavo maltiečių architektas Gerolamo Cassaras. Darbai buvo baigti 1577 m. ir dedikuoti šventajam Jonui Krikštytojui, vienam iš dviejų ordino globėjų. Jono’ko katedra Valetoje demonstruoja krikščionybės svarbą Maltos šaliai. Iš išorės ši XVI a. katedra gal ir neatrodo daug, tačiau žvilgtelėkite į vidų ir jūsų laukia tikra staigmena. XVII a. katedra buvo atnaujinta ir pasižymi puošniu barokiniu dekoru. Be turtingo barokinio meno ir relikvijų, Ko katedroje taip pat yra įspūdingų barokinių freskų, puošnių marmurinių grindų, trimačių statulų, raižytų akmeninių sienų ir kvapą gniaužiančių skliautų lubų, kurias dekoravo žinomas italų baroko dailininkas Mattia Preti. Ko-katedroje taip pat yra vienas iš labiausiai pasaulyje pripažintų Mikelandželo Merisio da Karavadžo darbų, žinomas kaip "Šventojo Jono Krikštytojo galvos nukirtimas" (1608 m.). Oratorijoje esantis paveikslas yra didžiausias Karavadžo kūrinys ir vienintelis, ant kurio yra jo parašas. Kiekvieną metų dieną lankytojai keliauja į katedrą, norėdami išvysti garsųjį meno kūrinį, o daugelis sugrįžta į katedrą kiekvieną kartą, kai būna saloje. Pačią katedrą sudaro devynios iš abiejų pusių iškalbingai dekoruotos koplyčios; aštuonios iš jų buvo pastatytos kiekvienai Šventojo Jono riterių kalbai, o devintoji skirta jų globėjai, kitai ordino globėjai Dievo Motinai Filermos. Paskutinėje koplyčioje taip pat saugoma senovinė Filermo ponios ikona, kurią riteriai laikė šventu daiktu. Maltos Švento Jono ko-katedroje taip pat yra paslaptinga kripta, kurioje yra buvusių Švento Jono riterių didžiųjų magistrų kapai.
