Sākotnēji šī 13. gadsimtā uzceltā un jūrnieku aizbildnim Sv.Nikolajam veltītā baznīca bija koka būve. 13. gs. beigās tika nolemts uzcelt mūra baznīcu. Sākotnēji Oude Kerk bija romiešu halles baznīcas veidols - pirmā šāda veida baznīca Nīderlandē. Baznīcu 1306. gadā iesvētīja Utrehtas katoļu bīskaps Gijs van Avesnes van Henegouwen, kura skulpturāli veidoto kapu joprojām var apskatīt pie Utrehtas Doma.1340. gadā Oude Kerk tika paplašināta līdz pilsētai, kurā tolaik dzīvoja trīs līdz četri tūkstoši iedzīvotāju, ārkārtīgi lielai celtnei. Brīnišķīgi, ka lielie Amsterdamas ugunsgrēki 1421. un 1452. gadā, kas izpostīja tolaik lielākoties no koka celto pilsētu, Oude Kerk nekaitēja.Baznīca 14. un 15. gadsimtā bija Amsterdamas draudzes baznīca, un, tā kā pilsēta strauji auga, Oude Kerk vairākkārt tika pārbūvēta un paplašināta. 1565. gadā Oude Kerk ieguva zvanu torni, un kopš tā laika tās arhitektūra nav daudz mainījusies.