Tunkinsky nacionaliniam parkui būdingas kalnuotas ir stipriai sulaužytas reljefas. Pagrindinis parko vandens kelias yra Irkuto upė su keliais intakais. Parko augmeniją atstovauja kalnų pievos, kalnų tundra, taiga ir kalnų taigos bendruomenės. Šio regiono Flora yra labai įvairi. Tunkinsky parko teritorijoje auga daugiau nei 900 rūšių kraujagyslių augalų, iš kurių daugiausia yra pievų ir miško planta.
Parko fauna taip pat yra gana įvairi. Čia gyvena daugiau nei 40 rūšių gyvūnų. Iš didelių ir vidutinių faunos atstovų būtina išskirti: plaukiojančią voverę, ilgauodegę voverę, sabalą, šeškų stepę, žebenkštį, briedį, kiškį, burunduką, muskratą, barzdą, erminą, rudąjį lokį, elnius, stirną, šerną, muskuso elnius ir pan.
Nacionalinio parko teritorijoje yra daug nuostabių gamtos paminklų, pavyzdžiui: "marmuro dugnas", "Khongor-Uula" šaltinis, vaizdingas "Hobokskoye ežeras".