Der Tunkinsky-Nationalpark zeichnet sich durch ein gebirgiges und stark zerklüftetes Gelände aus. Die Hauptwasserstraße des Parks ist der Irkut-Fluss mit mehreren Nebenflüssen. Die Vegetation des Parks wird durch Bergwiesen-, Gebirgstundra-, Taiga- und Berg-Taiga-Gemeinschaften repräsentiert. Die Flora dieser Region ist äußerst vielfältig. Mehr als 900 Arten von Gefäßpflanzen wachsen auf dem Territorium des Tunkinsky-Parks, die zahlreichsten davon sind Wiesen- und Waldplanta.
Auch die Fauna des Parks ist sehr vielfältig. Mehr als 40 Tierarten leben hier. Von den großen und mittelgroßen Vertretern der Fauna muss man unterscheiden: Flughörnchen, Langschwanzhörnchen, Zobel, Frettchensteppe, Wiesel, Elch, Hase, Streifenhörnchen, Bisamratte, Dachs, Hermelin, Braunbär, Hirsch, Reh, Wildschwein, Moschushirsch und so weiter.
Auf dem Territorium des Nationalparks gibt es zum Beispiel viele erstaunliche Naturdenkmäler: "Marmorboden", die Quelle von "Chongor-Uula", der malerische "Hobokskoje-See".