Athén oszmán hódításakor jelentős változás következett be a városképben. A szultán rendelete lehetővé tette, hogy Athén többnemzetiségű várossá váljon, azzal az utasítással, hogy a rezsim megszállása alatt a legtöbb templomot és műemléket meg kell védeni és újra közhasználatra kell fordítani.1759-ben Mustapha Agha Tzistarakis, Athén oszmán kormányzója elrendelte egy mecset építését a Monastiraki téren. Tzistarakis azonban a szultáni rendeletnek ellentmondó módon felügyelte egy ókori görög templom egyik oszlopának lerombolását, amelyről úgy vélték, hogy vagy az Olümposzi Zeusz temploma, vagy Hadrianus könyvtára volt, hogy meszet szerezzenek a mecset építéséhez.Ez a cselekedet helyi babonához vezetett, mivel úgy vélték, hogy a templomok lerombolása járványokat hoz. Ennek következtében a feldühödött helyiek arra kényszerítették a szultánt, hogy Tzistarakiszt Athénból száműzze, egyfajta megbékélésként. Ez a száműzetés azonban nem volt elég, mivel Tzistarakiszt később meggyilkolták.A Tzistarakis mecset, egy négyzet alakú kétszintes épület, nyolcszögletű alapon félgömb alakú kupolával, a görög függetlenségi háborúig mecsetként szolgált. Az oszmánoktól való függetlenség elnyerése után a görög kormány különböző célokra használta át az épületet, többek között a vének gyülekezési termeként, börtönként, laktanyaként, raktárként, valamint katonai koncertek és rendezvények helyszínéül. A minaret, amely az épületet díszítette, valamikor 1839 és 1843 között pusztult el.1915-ben az épületet felújították, és 1918-ban Görög Kézműves Múzeumként nyitották meg újra. A földszinten 1920-ban további irodákat alakítottak ki, és a múzeumot 1923-ban Díszítőművészeti Múzeumra keresztelték át. 1966-ban az épületet ideiglenesen felújították, hogy Szaúd-Arábia szaúdi királya athéni látogatása során imahelyként szolgáljon. 1975 óta a Görög Népművészeti Múzeum melléképületeként is működik. Az 1981-es földrengést követően az épületet helyreállították, és 1991-ben újra megnyitották a nagyközönség előtt, további kiállítóteret biztosítva a múzeumi célokra. Ez a szövevényes történet bemutatja, hogy a Tzistarakis mecset miként vált Athén örökségének maradandó részévé, és hogyan alakult, hogy az évszázadok során különböző szerepeket töltsön be.