Osmaņiem iekarojot Atēnas, pilsētas ainavā notika ievērojamas pārmaiņas. Sultāna edikts ļāva Atēnām kļūt par daudznacionālu pilsētu, un tajā bija noteikts, ka režīma okupācijas laikā lielākā daļa tempļu un pieminekļu ir jāaizsargā un jāpārveido publiskai lietošanai.1759. gadā Atēnu osmaņu gubernators Mustafa Agha Tzistarakis lika Monastiraki laukumā uzcelt mošeju. Tomēr Tzistarakis rīkojās pretēji sultāna rīkojumam un pārraudzīja viena sengrieķu tempļa, kas, domājams, bija vai nu Olimpijas Dzeusa templis, vai Hadriāna bibliotēka, viena no pīlāriem iznīcināšanu, lai iegūtu kaļķus mošejas celtniecībai.Šī rīcība izraisīja vietējos māņticību, jo tika uzskatīts, ka tempļu iznīcināšana izraisīs epidēmijas. Tāpēc sašutušie vietējie iedzīvotāji piespieda sultānu, lai viņš kā mierinājumu izsūtītu Cistaraku no Atēnām. Tomēr ar šo izraidīšanu nepietika, jo vēlāk Tzistarakis tika nogalināts.Tzistarakis mošeja, kvadrātveida divstāvu ēka ar puslodes formas kupolu uz astoņstūra pamatnes, kalpoja kā mošeja līdz pat Grieķijas Neatkarības karam. Pēc neatkarības atgūšanas no osmaņiem Grieķijas valdība ēku izmantoja dažādiem mērķiem, tostarp kā vecāko sanāksmju zāli, cietumu, kazarmas, noliktavu un militāro koncertu un pasākumu norises vietu. Minarets, kas rotāja ēku, tika nopostīts kaut kad starp 1839. un 1843. gadu.1915. gadā ēka tika atjaunota, un 1918. gadā to atkal atklāja kā Grieķu amatniecības muzeju. Pirmajā stāvā 1920. gadā piebūvēja papildu kabinetus, un 1923. gadā muzejs tika pārdēvēts par Dekoratīvās mākslas muzeju. 1966. gadā ēku uz laiku pārbūvēja, lai tā kalpotu kā lūgšanu vieta Saūda Arābijas karalim Saūda apmeklējuma laikā Atēnās. Kopš 1975. gada tā darbojas arī kā Grieķijas Tautas mākslas muzeja piebūve. Pēc 1981. gada zemestrīces ēka tika atjaunota un 1991. gadā atkal atvērta apmeklētājiem, un tajā tika ierīkotas papildu izstāžu telpas muzeja vajadzībām. Šī sarežģītā vēsture parāda, kā Tzistarakis mošeja ir bijusi paliekoša Atēnu mantojuma daļa, gadsimtu gaitā attīstoties un pildot dažādas funkcijas.
