Ob osmanski osvojitvi Aten se je pokrajina mesta močno spremenila. Sultanov odlok je omogočil, da so Atene postale večetnično mesto, z navodilom, da je treba večino templjev in spomenikov zaščititi in ponovno uporabiti za javno rabo med okupacijo režima.Leta 1759 je osmanski guverner Aten Mustafa Agha Tzistarakis ukazal gradnjo mošeje na trgu Monastiraki. Vendar je Tzistarakis v nasprotju s sultanovim ukazom nadzoroval uničenje enega od stebrov starodavnega grškega templja, ki naj bi bil bodisi tempelj olimpijskega Zevsa bodisi Hadrijanova knjižnica, da bi pridobil apno za gradnjo mošeje.To dejanje je povzročilo lokalno vraževerje, saj so verjeli, da uničenje templjev prinese epidemije. Zato so razjarjeni domačini pritisnili na sultana, da je Tzistarakisa izgnal iz Aten, da bi ga pomiril. Kljub temu izgnanstvo ni bilo dovolj, saj je bil Tzistarakis pozneje umorjen.Tzistarakisova mošeja, kvadratna dvonadstropna stavba s polkrožno kupolo na osmerokotnem podstavku, je služila kot mošeja vse do grške vojne za neodvisnost. Po osamosvojitvi od Osmanov je grška vlada stavbo ponovno uporabila za različne namene, med drugim kot dvorano za srečanja starešin, zapor, vojašnico, skladišče ter prizorišče vojaških koncertov in prireditev. Minaret, ki je krasil stavbo, je bil uničen nekje med letoma 1839 in 1843.Leta 1915 je bila stavba prenovljena in leta 1918 ponovno odprta kot Muzej grških obrti. Leta 1920 so v pritličju zgradbe dodali dodatne pisarne, leta 1923 pa se je muzej preimenoval v Muzej dekorativnih umetnosti. Leta 1966 je bila stavba začasno prenovljena, da bi služila kot prostor za molitev savdskega kralja Sauda med njegovim obiskom v Atenah. Od leta 1975 deluje tudi kot priloga Muzeja grške ljudske umetnosti. Po potresu leta 1981 je bila stavba obnovljena in ponovno odprta za javnost leta 1991, z dodatnim razstavnim prostorom za muzejske namene. Ta zapletena zgodovina prikazuje, kako je bila mošeja Tzistarakis trajen del atenske dediščine, ki se je skozi stoletja spreminjala in opravljala različne vloge.
