Biserica Santa Maria di Rivotorto se află la câțiva kilometri de Santa Maria degli Angeli, și a fost construit într-un stil neo-Gotic în urma cutremurului din anul 1854, pe site-ul unei cladiri anterioare construit pentru a proteja "Tugurio francescano", care este acum păstrat în interiorul bisericii. Acestea sunt ruinele unui loc în care, spune tradiția, Sfântul și tovarășii săi s-au refugiat să se roage și să mediteze. Pe fațada bisericii sunt crestele de Bazilica Saint Francis (care sanctuarul depins) și, mai presus de ușa principală, fraza: "Hic primordia Fratrum Minorum" (Aici începuturile Fraților Minori), care amintește tradiția, conform căreia Sfântul Francisc a elaborat bazele de Regula Franciscană.
Interiorul bisericii are trei nave, separate prin coloane poligonale. Aici veți găsi umil "tugurio di somma umilitate", pe site-ul unde a fost descoperit, locul sfânt s-a refugiat cu Bernardo da Quintavalle și Pietro di Catanio. Este format din trei încăperi mici, a doua dintre ele fiind folosită ca capelă, cu un altar de comuniune din secolul al XV-lea pe un cip octogonal. În biserică, pe contra-fațadă, se află o pictură a Sfântului Arhanghel Mihail de Domenico Mattei. Pe pereți sunt picturi de Cesare Sermei care fac aluzie la istoria Franciscană.