Crkva Santa Maria di Rivotrorto udaljena je nekoliko kilometara od Santa Maria degli Angeli i izgrađena je u neogotičkom stilu nakon potresa 1854. godine na mjestu prethodne zgrade izgrađene kako bi zaštitile "Tugurio francescano", koja se sada čuva unutar crkve. To su ruševine mjesta na kojima su, prema legendi, svetac i njegovi drugovi pronašli utočište za molitvu i meditaciju. Fasada crkve prikazuje grbe Bazilike sv. Franje (na kojem je svetište ovisilo), a iznad glavnog ulaza - natpis: "hic primordia Fratrum Minorum" (ovdje-početak bratstva male braće), podsjećajući na tradiciju prema kojoj je sveti Franjo sastavio temelje franjevačke vladavine.
Unutar crkve nalaze se tri Nefa odvojena poligonalnim stupovima. Ovdje ćete naći skromni "tugurio di Somma umilitate", na mjestu gdje je otkriven, mjesto gdje se svetac sklonio zajedno s Bernardo da Quintavalle i Pietro di Catanio. Sastoji se od tri male sobe, od kojih se druga koristi kao kapela, s oltarom sakramenta petnaestog stoljeća na osmerokutnom kippusu. U crkvi, na suprotnoj fasadi, nalazi se slika Svetog Mihaela arhanđela Domenico Mattei. Na zidovima se vješaju slike Cesare Sermei koje upućuju na franjevačku Povijest.
