Het kerkmuseum van San Francesco, gebouwd voor de kleine broeders tussen 1335 en 1338. Het museum is ingedeeld in drie expositieruimtes: de ex-kerk, de hele wereld bekend om de fresco cyclus geschilderd door Benozzo Gozzoli tussen 1450 en 1452 dat verbeeldt het Leven van Franciscus, en er is ook weer een Natività door Perugino (begin 16e eeuw), en de fresco ' s van de Umbrische school; de Art Gallery met werken van Francesco Melanzio, Antoniazzo Romano en de Umbrische school uit de jaren 1300 tot 1700; en de crypte met archeologische vondsten, beelden en stukken uit verschillende tijdperken
