Η Εκκλησία της Santa Maria di Rivotorto βρίσκεται λίγα χιλιόμετρα από τη Santa Maria degli Angeli και χτίστηκε, σε νεο-γοτθικό στιλ μετά το σεισμό του 1854, στη θέση ενός προηγούμενου κτιρίου που χτίστηκε για να προστατεύσει το "Tugurio francescano" που τώρα φυλάσσεται μέσα στην εκκλησία. Αυτά είναι τα ερείπια ενός τόπου όπου, σύμφωνα με την παράδοση, ο άγιος και οι σύντροφοί του κατέφυγαν για να προσευχηθούν και να διαλογιστούν. Στην πρόσοψη του ναού είναι τα οικόσημα της Βασιλικής του Αγίου Φραγκίσκου (το οποίο το ιερό εξαρτιόταν από) και, πάνω από την κύρια πόρτα, η φράση: "Hic blackwell χωρίς περιορισμούς Fratrum Minorum" (Εδώ οι απαρχές του Friars Minor), το οποίο υπενθυμίζει την παράδοση, σύμφωνα με την οποία Saint Francis συνέταξε τα θεμέλια των Φραγκισκανών Κανόνα.
Το εσωτερικό του ναού έχει τρία κλίτη, που χωρίζονται από πολυγωνικούς κίονες. Εδώ θα βρείτε το ταπεινό "tugurio di somma umilitate", στο χώρο όπου ανακαλύφθηκε, το μέρος που ο Άγιος κατέφυγε με τον Bernardo da Quintavalle και τον Pietro di Catanio. Αποτελείται από τρία μικρά δωμάτια, το δεύτερο από τα οποία χρησιμοποιείται ως παρεκκλήσι, με βωμό κοινωνίας του δέκατου πέμπτου αιώνα σε οκταγωνικό κρυπτό. Στην εκκλησία, στην αντίθετη πρόσοψη, είναι ένας πίνακας του Αγίου Μιχαήλ Αρχαγγέλου από τον Domenico Mattei. Στους τοίχους υπάρχουν πίνακες του Cesare Sermei που παραπέμπουν στην ιστορία των Φραγκισκανών.
