1800. gadu sākumā sāls noliktava aizņēma zemi, kas vēlāk turēs Prezidenta Pili. Viens no Helsinku veiksmīgākajiem tirgotājiem, Johans Henriks Heidenstrauhs, nopirka partiju un uzcēla tur savu māju. Heidenstrauch māja, kuru projektējis Pehr Granstedt, pievērsa uzmanību tam, ka tā ir daudz grandiozāka nekā tā laika tipiskās tirgotāju mājas. Amatpersonas pamanīja, un mājas tika iegādātas Somijas ģenerālgubernatoram 1837.gadā.
Cars Nikolajs I arī redzēja mājas potenciālu un pieprasīja, lai ēka kļūtu par viņa oficiālo Helsinku rezidenci. Pils tika atjaunota laikā no 1843.līdz 1845. gadam. Šajā laikā tika pievienots jauns spārns, kurā bija kapela, banketu zāle, virtuve un balles zāle. Imperatora ģimene neizmantoja māju līdz 1854.gadam, kad Lielkņazs Konstantīns apmeklēja vienu mēnesi. Pēdējo reizi imperatora ģimene ēku izmantoja Nikolaja II vienas dienas vizīte 1915.gadā.
Pirmā Pasaules kara laikā pils tika izmantota kā militārā slimnīca. Kad Cars / Somijas Lielkņazs atteicās no troņa 1917. gadā, pils kļuva par Senāta īpašumu. Viņi pārdēvēja ēku un izmantoja to kā galveno mītni līdz Somijas pilsoņu kara beigām. Bijušo imperatora pili vēlāk izmantoja vācieši un baltais somu militārais štābs kā prinča Frederika potenciālo dzīvesvietu un kā Ārlietu ministrija.
Kad Somija 1919.gadā pieņēma jaunu konstitūciju, ēka tika izvēlēta par prezidenta oficiālo dzīvesvietu. Bijusī Imperatora pils tika salabota,un tās sākotnējās mēbeles tika atgrieztas. Prezidenta pilī līdz 1993.gadam atradās visi Somijas prezidenti, izņemot trīs. Šodien prezidents dzīvo Mäntyniemi, piejūras rezidencē Helsinku rietumos.
