Vezuvijaus observatorija buvo pastatyta už dviejų kilometrų nuo Vezuvijaus kraterio tuo metu, kai mokslas apskritai ir ypač žemės magnetizmo tyrimai buvo labai populiarūs. Nuo to laiko iki šių dienų observatorijos istorijoje keitėsi puikybės ir nuosmukio laikotarpiai.Po penkis šimtmečius trukusios ramybės 1631 m. įvykęs niokojantis Vezuvijaus išsiveržimas sukėlė beveik nuolatinį aktyvumą, dėl kurio atsirado poreikis nuolat stebėti reiškinius, kad būtų galima prognozuoti jų elgseną; XVII a. pabaigoje šį poreikį skatino net karalius Karolis Burbonas. 1767 m. Giovanni Maria della Torre atliko kruopščius magnetinės deklinacijos tyrimus, o XIX a. pirmoje pusėje Vezuvijus buvo labiausiai analizuojama vulkaninė vietovė pasaulyje, pritraukusi mokslininkus iš viso pasaulio, tarp jų ir Charlesą Babbage'ą, norėjusį patikrinti savo teorijas apie šilumos laidumą.XIX a. pradžioje mokslo akademijos prašė įvairių šalių vyriausybių pastatyti centrą, kuriame jos galėtų apsistoti, ir Ferdinandas II Burbonas, padedamas ministro Nikolos Santanjelo, patenkino šį prašymą - abu jie rėmė mokslo ir technologijų plėtrą (pakako, kad būtų nutiestas pirmasis Italijos geležinkelis). Fizikui Makedonijui Melloniui (Macedonio Melloni) buvo pavesta užduotis 1839 m. įkurti Meteorologijos observatoriją. Būtent jis nupirko magnetinę ir meteorologinę įrangą pasirinktai vietai - Collina del Salvatore (Išganytojo kalva), kuri atitiko tris Melloni keliamus reikalavimus: "laisvas horizontas, debesų artumas, atstumas nuo aplinkinių žemių".1848 m. kovo 16 d. observatorija pagaliau buvo perduota Melloni, tačiau dėl savo liberalių idėjų jis buvo atleistas iš pareigų po 48-ųjų metų sukilimų. Geofiziko Luidžio Palmieri susidomėjimas atgaivino observatorijos padėtį. 1856 m. buvo baigtas statyti meteorologijos bokštas. Palmieri pastatė pirmąjį istorijoje elektromagnetinį seismografą, kuriuo patikrino vulkaninių ir seisminių procesų atitikimą. 1862 m. Palmieri parengė mokslinių tyrimų programą, kurią sudarė stočių tinklas, skirtas įvairiems parametrams, naudingiems tam tikru būdu numatyti ugnikalnių aktyvumą, tirti; nuo to momento gimė modernus tyrimo metodas. Observatorijai ir jos svečiams netrūko dramų, nes 1872 m. observatoriją apsupo lavos banga ir ji kelioms dienoms buvo izoliuota.Palmieri įpėdinis prie centro vairo buvo geologas Raffaele Matteucci, kuris užėmė pirmuosius laikraščių puslapius dėl aštraus ginčo su Matilde Serao, kilusio dėl nesusipratimo dėl tikrųjų Matteucci ketinimų dar vieno išsiveržimo metu. vadovavimą centrui, kurio būklė buvo labai prasta, perėmė Giuseppe Mercalli, kuris stengėsi atgaivinti centro būklę, tačiau tragiška mirtis nutraukė jo darbą. Per karą sąjungininkai centrą rekvizavo; nuo 1983 m., pačiame Flegros bradzeizmo įkarštyje, operatyvinė būstinė buvo perkelta į visuomeninį pastatą Neapolyje, ant Posillipo kalvos. Šiandien operatyvinių tyrimų ir stebėjimo būstinė yra Neapolyje, Via Diocleziano 328, o istorinėje Vezuvijaus vietoje įsikūręs vulkanologijos muziejus, kuriame, be kita ko, galima pasigrožėti senoviniais meteorologiniais ir geofiziniais prietaisais, sukurtais žymių mokslininkų, kurie čia dirbo daugiau kaip 150 metų.