Axel Munthe tuli esimest korda Caprile 18-aastaselt. Sel korral "põrkas" tulevane arst kokku saare reaalsusega, mis erines täielikult Pariisi või vähemalt Euroopa reaalsusest, millega ta oli harjunud. Ta sattus tegelikult kokku puutuma inimestega, kes erinesid täiesti tema tavapärastest tuttavatest. Capril oli igaühel, sõltumata tema sotsiaalsest päritolust, väga täpne roll "kogukonnas", mida dikteerisid väga sageli traditsioonid ja harjumused. Ühe sellise isiksuse, Maria Portalettere, saatel sattus Axel Munthe Rooma keisri Tiberiusele kunagi kuulunud palee jäänustele, mida ääristavad kasutuseta kabel ja viinamarjaistandus, mis kuulus mastro Vincenzole, teisele saare elanikule. Ta oli saare ilust nii vaimustunud, et tajus isegi selle vaimu, mida allegooriliselt kujutas "rikkalikku mantlisse mähitud" kuju, kellega ta sõlmis "vaimse lepingu", mille kohaselt sai ta selle maa, millele villa pidi ehitama, õigustatud omanikuks ainult siis, kui ta loobus "ambitsioonist teha endale nime [oma] ametis".Munthe pühendas seega suure osa oma elust villa ja aia ehitamisele. Tollal olid Capri aiad täis maast välja tulnud leide Rooma villadest, talupojad nimetasid seda "Tibberio kraamiks" ja andsid selle spontaanselt doktorile, kes lisas selle oma Rooma, etruskide ja Egiptuse esemete kollektsiooni, mida ta oli oma reiside käigus kogunud.Villa San Micheles saab imetleda peamiselt Medusa pead, mis kaunistas Rooma Veenuse templit, keskaegse pühakunsti esemeid, 18. sajandi Toscana mööblit, freskosid ja Rooma skulptuure, nagu keiser Tiberiuse marmorist büst, Cosmateski marmortahvlilaud, Sitsiilia sepistatud raudlüster ja Egiptuse sfinkss. Viimasest on saanud peaaegu Axel Munthe elukoha sümboliks ja see asub kogu Villa San Michele ühes panoraamseisukohas. Legendi kohaselt, kui asetada vasak käsi sfinksile ja esitada soov, vaadates samal ajal Capri merele, täitub see soov.Aias saab imetleda mitmeid Vahemere taimestikule iseloomulikke taimi - nagu kameeliad, hortensiad, kaunid roosipõõsad, männid ja küpressid -, mida ümbritseb tüüpiline valge kolonnaad koos pergolaga, mis on üks kohalikele villadele iseloomulikke tunnuseid. Lisaks sellele avaneb aiast erakordne vaade Napoli lahele. Villa San Michele on tänapäeval üldsusele avatud muuseum ja suvel toimub seal muusikafestival Concerti al Tramonto.Villa ehitamise lugu jutustas hiljem Munthe oma raamatus "Storia di San Michele", mis on maailma enim tõlgitud raamatute hulka jõudnud bestseller.
