Obecnie Muzeum Miejskie w Brnie należy do najlepszych muzeów w kraju i mieści się w kilku zabytkowych budynkach miasta: zamku Špilberk, bramie Měnínskiej i willi Tugendhat. Špilberk jest centralną lokalizacją, ponieważ mieści administrację Muzeum, biblioteki, archiwum fotograficzne i większość wyspecjalizowanych pracowników. Pomieszczenia zamku służą jako depozyt i miejsce stałych wystaw, a także innych pokazów związanych głównie z historią i kulturą Brna. Muzeum Miejskie w Brnie zarządza również willą Tugendhat, głównym przykładem nowoczesnej architektury wpisanej na Listę Światowego Dziedzictwa UNESCO.