Poznat po svojim konzervatorskim naporima, zoološki vrt San Diego održava nekoliko izložaka ugroženih vrsta i radi s konzervatorskim skupinama širom svijeta kako bi potaknuo zaštitu ugroženih divljih životinja. Ogroman rezervat ima neuredne slikovite staze i ispričane autobusne izlete. "Majmunske staze" u srcu zoološkog vrta uključuju azijske i afričke šume s više od 30 vrsta egzotičnih ptica, sisavaca, gmazova i vodozemaca. Na" tigrovoj rijeci", maglovite staze su među vodopadima u kišnoj šumi s više od 5.000 vrsta egzotičnih biljaka i tigrova, burmanskih pitona i malezijskih tapira. Najpopularnija izložba je Pacific Bell Giant Panda Research Station, gdje je rođeno nekoliko ugroženih Panda. Štenci pande su veliki hit, a kavez za ptice često stvara dugačke redove. Zoološki vrt održava nekoliko događaja "nakon mraka", uključujući nastupe žive glazbe i susrete životinja u blizini.