Įtvirtintą Šibeniko miestą kroatai įkūrė maždaug 9-ajame amžiuje. Dėl viduramžių Kroatijos valstybės plėtros Miestas Šibenikas padarė pažangą ir pirmą kartą buvo paminėtas 11-ajame amžiuje dokumente, kurį parašė karalius Petaras Krešimiras IV. netrukus už šį miestą kovojo daug skirtingų tautų-nuo Austrijos-Vengrijos monarchijos per Bizantiją iki Venecijos, tačiau miestas vis dar padarė pažangą, skleisdamas ir plėtodamas savo kultūrą, meną, navigaciją, prekybą ir ekonomiką apskritai. Šibenikas buvo Venecijos valdžioje ilgus 400 metų, tačiau nuo to laikotarpio šiandien turime svarbiausias istorines ir kultūrines Šibeniko vietas. Tarp jų taip pat yra pagrindinis miesto simbolis šiandien – Šv.