Sediul central este arsenalele Medici, pe Lungarno pisano, o serie de hale folosite ca arsenale pentru construcția și întreținerea galerelor Cavalerilor din Santo Stefano corpul de cavalerie folosit pentru apărarea navală împotriva amenințării Sarazine. Pe fațada arsenalelor, de fapt, o serie de inscripții comemorează principalele victorii ale Cavalerilor împotriva Saracenilor. Arsenalele au intrat curând în uz și au fost ocupate de structuri militare și apoi de grajduri. Până la primul postbelic au adăpostit Centrul de creștere a cailor al armatei italiene; o parte din stazzi și structurile folosite pentru adăpostirea cailor au fost păstrate în cadru, pentru a păstra amintirea acestei importante faze istorice. O poveste de 1000 de ani despre comerț și marinari, rute și naufragii, navigație și viață la bord și istoria orașului Pisa. 800 de exponate expuse în 8 secțiuni tematice, în cadrul cărora secțiunile Muzeului vânt, într-o secvență logică. Orașul dintre cele două râuri, pământ și ape, furia apelor, Navalia, Nave, meserii, navigație, viață la bord.
