Το Αρχαιολογικό Μουσείο Πυθαγορείου στεγάζει περίπου 3.000 αντικείμενα που βρέθηκαν σε ανασκαφές στην αρχαία πόλη της Σάμου και σε άλλες ανασκαφές σε όλο το νησί. Τα εκθέματα αυτά δείχνουν την ιστορική πορεία του νησιού από την 5η χιλιετία π.Χ. έως τον 7ο αιώνα μ.Χ. και απεικονίζουν την πολιτική σημασία της Σάμου κατά την αρχαιότητα.
Η γσυλλογή των "νεκροδέπνων" του μουσείου ξεχωρίζει ως μοναδικός θησαυρός. Πρόκειται για ανάγλυφα που απεικονίζουν νεκρικά συμπόσια, προσφέροντας πληροφορίες για τα αρχαία ταφικά έθιμα και πεποιθήσεις. Ένα ευρύ φάσμα κεραμικών, που χρονολογούνται από τον 9ο αιώνα π.Χ. έως τον 2ο αιώνα π.Χ., εμπλουτίζει περαιτέρω τις προσφορές του μουσείου.
Μεταξύ των εκθεμάτων που πρέπει να δείτε είναι:
Ένα μαρμάρινο καθιστό άγαλμα του Αίαντα, που χρονολογείται γύρω στο 540 π.Χ. Η επιγραφή αποκαλύπτει ότι αφιερώθηκε στη θεά Ήρα από τον Αίαντα, πατέρα του Πολυκράτη. Το ενδιαφέρον είναι ότι χρηματοδοτήθηκε από τον πλούτο που απέκτησε ο Αιακός από την πειρατεία.
Μια μεγαλοπρεπής μαρμάρινη σαρκοφάγος, φιλοτεχνημένη ώστε να μοιάζει με ναοδομία, προερχόμενη από το δεύτερο μισό του 6ου αιώνα π.Χ.
Μια μικρή επιτύμβια στήλη από πόρο που κοσμείται με ένα τελείωμα από φοινικέλαιο και φέρει την επιγραφή "ΔΙΑΓΟΡΟΣ ΠΡΟΣ ΓΔΙΛΟ", η οποία χρονολογείται στο 530 π.Χ.
.Άλλη μια μαρμάρινη επιτύμβια στήλη με πτερύγιο φοινικιάς, που ανακαλύφθηκε στη Χώρα και χρονολογείται στο 500/490 π.Χ.
Ένα υπερμεγέθες μαρμάρινο άγαλμα του Ρωμαίου αυτοκράτορα Τραϊανού, με επιβλητικό ύψος 2,71 μέτρα.
Περιληπτικά μαρμάρινα πορτρέτα των Ρωμαίων αυτοκρατόρων Αυγούστου και Κλαύδιου, ύψους 0,49 και 0,53 μέτρων αντίστοιχα.
Είτε είστε λάτρεις της ιστορίας, της τέχνης ή απλώς περίεργοι για το παρελθόν, το Αρχαιολογικό Μουσείο Πυθαγορείου προσφέρει μια συναρπαστική εμπειρία. Κάθε τεχνούργημα αφηγείται μια ιστορία, προσφέροντας μια απτή σύνδεση με τον αρχαίο κόσμο και τους πολλούς πολιτισμούς που άφησαν το σημάδι τους στη Σάμο.
Το μουσείο βρίσκεται σε βολική τοποθεσία, καθώς απέχει περίπου 300 μέτρα από την πρόσοψη του λιμανιού.