Відомий своїми зусиллями по збереженню, зоопарк Сан-Дієго підтримує кілька експонатів зникаючих видів і працює з природоохоронними групами по всьому світу, щоб заохочувати захист знаходяться під загрозою зникнення диких тварин. У величезному заповіднику є безладні мальовничі доріжки і розказані автобусні екскурсії. "Мавпячі стежки" в самому серці зоопарку включають азіатські та африканські ліси з більш ніж 30 видами екзотичних птахів, ссавців, рептилій і амфібій. На" тигровій річці " туманні стежки в'ються серед водоспадів в тропічному лісі з більш ніж 5000 видами екзотичних рослин і тиграми, бірманськими пітонами і малайзійськими тапірами. Найпопулярнішим експонатом є дослідницька станція Pacific Bell Giant Panda Research Station, де народилося кілька знаходяться під загрозою зникнення панд. Дитинчата панд-великий хіт, і у вольєра часто утворюються довгі черги. У зоопарку проводиться кілька заходів "після настання темряви", включаючи виступи живої музики і зустрічі з тваринами поблизу.
