Те си проправят път под земята на Рим, по протежение на Апианския път, в поредица от наистина страховити на вид тунели, обхващащи разстояние от над 25 км тунели, разпределени на четири нива и достигащи дълбочина над 20 метра. Според традицията те се простират на още 200 км под земята в Лацио. Катакомбите са били места за погребения и са се превърнали в поклоннически места за първите християни, преследвани от Римската империя. Това е място с богата история, заобиколено от магическа, уникална и ценна атмосфера. В тези катакомби са погребани неизвестен брой мъченици, 16 понтифици и много обикновени хора. Името им произлиза от името на дякона Свети Калист, който в началото на III в. е назначен от папа Зефирин за управител на гробището и така катакомбите на Свети Калист стават официално гробище на Римската църква.
В подземието се виждат две малки базилики с три апсиди, наречени "Tricore". В източната вероятно са били погребани папа Зефирин и младият мъченик на Евхаристията, свети Тарсисий.
Подземното гробище се състои от няколко зони. Криптата на папите е най-свещеното и важно място в тези катакомби, наричано "малкият Ватикан", защото там са погребани 9 папи и вероятно 8 висши църковни дейци от III век. По стените са изписани оригиналните надписи на гръцки език на 5 папи. На четири надгробни плочи до името на понтифика е изписана титлата "епископ", тъй като папата е смятан за глава на Римската църква, а на две надгробни плочи е изписано и гръцкото съкращение "MPT" (мъченик).
Криптата на Света Сесилия, популярната покровителка на музиката. Произхожда от знатно римско семейство и е мъченически убита през III в. Погребана на мястото, където сега се издига статуята ѝ, тя е била почитана тук в продължение на поне пет века. През 821 г. мощите ѝ са пренесени в посветената на нея базилика в Трастевере. Статуята на Света Чечилия е копие на известната творба на Мадерно, изваяна през 1599 г. Криптата е украсена със стенописи и мозайки. На стената до статуята има старинно изображение на Света Чечилия в молитвено положение; долу, в малка ниша, е изобразен Спасителят, който държи Евангелието; до него има картина на мъченика папа Урбан. На едната стена на прозореца са изобразени фигурите на трима мъченици: Поликам, Себастиан и Квирин. това са най-старите ядра (II в.).
Преминавайки през внушителни галерии, пълни с локуми, стигаме до пет малки стаи, истински семейни гробници, наречени кубикули на тайнствата и особено важни заради фреските си. Стенописите датират от началото на III в. и символично изобразяват тайнствата Батезим и Евхаристия. Там е изобразен и пророк Йона, символ на възкресението.
