Церковь и бенедиктинский монастырь на острове Святой Марии в Млете являются одними из старейших церковных комплексов Адриатики. История церкви и монастыря начинается в 1151 году, когда бенедиктинские монахи из Апулии, южного региона Италии на полуострове Гаргано, известного как Пульсанези-Эремит, получили остров Млет в подарок от герцога Захумле, нынешнего правителя современных регионов Герцеговины и Южной Далмации.
Бенедиктинцы, принадлежавшие аббатству Святой Майской пульсано (отсюда и название), построили романский монастырь и церковь Святой Марии на островке Святой Марии на развалинах уже существующего сакрального памятника. Первое упоминание о монастыре относится к 1220-ым годам, когда в официальных документах того времени упоминается имя монастыря Святой Марии.
Комплекс был реконструирован и расширен в течение 15 и 16 веков, когда к существующему зданию были добавлены части в стиле ренессанса. Весь монастырский комплекс был построен в стиле ренессансной виллы и сада. Церковь очень похожа на церковь Санта-Маргерита в Бишеглие, Апулия, Италия, которая была построена в тот же период (1197 г.). Башня и окружающие ее стены, окружающие монастырь, церковь и сад, были построены в конце 17 века.
Известно, что в конце 14 века монастырь использовался в качестве первого в Хорватии карантина, так как монахи также занимались аптекарями.
В то время весь островок Святой Марии представлял собой оливковую рощу, в которой растет около ста оливковых деревьев.
Бенедиктинцы владели островом и монастырем до 1808 года, когда они, как и Республика Рагуза, были упразднены Наполеоном Бонапартом. Они покинули монастырь 31.05.1808 года и с тех пор монастырская собственность перешла в собственность школы. Из-за очень высокого риска пиратских нападений весь монастырский комплекс был укреплен массивными стенами и башнями.
