Музей был создан в 1930-х годах в Епископском дворце, который был построен Коррадо Риччи в начале 20 века и обустроен благодаря канонику собора Маурицио Каваллини. Вынужденный закрыться из-за повреждений, полученных во время Второй мировой войны, он вновь открывался и снова закрывался попеременно до конца века перед лицом постоянных и длительных структурных вмешательств. Так он открылся в 1950-х годах, закрылся в 1980-х, снова открылся в 1990-х, пока не было принято менее обременительное решение перенести музей в прекрасную церковь Сант-Агостино.
Музей был возвращен к жизни благодаря проекту планировки, разработанному компанией Guicciardini & Magni Architetti; На выставке представлены работы из собора и, в небольшой степени, из церквей епархии; но ее главное достоинство в том, что она сохранила, помимо некоторых картин, скульптур из дерева и глины, священных облачений, единственные сохранившиеся мраморные скульптуры великих памятников XIV века, установленных в соборе.
Под лоджией пресвитерия находятся некоторые колонны 11 века. Вдоль лестницы находится перемычка церкви Сан Лоренцо а Монтальбано, датируемая 10 веком. Мраморный фриз с изображениями херувимов - работа Мино да Фьезоле. Одиннадцать трилистниковых арок и две мраморные колонны, возможно, принадлежащие древнему хору аббатства Сан-Джусто, украшены портретами аббатов и ангелов с готическими и латинскими надписями 14-го века.
В музее выставлены работы таких авторов, как: Доменико ди Микелино, Россо Фьорентино, Бальдассарре Франческини, Даниэле Риччарелли, Стефано ди Антонио Ванни, Антонио дель Поллайоло, Джамболонья и другие.