Упершыню царква Пеліцана згадваецца ў пергаменце ад 12 мая 1264 г. пад назвай «Sanctae Mariae»; таму яе аснову варта разгледзець раней.Тым не менш, царква была афіцыйна асвечана ў 1474 г., напрыканцы радыкальнай перабудовы сакральнага будынка, ужо згадванага ў дакуменце 1265 г. Сляды першапачатковай канструкцыі можна знайсці ў замураваным акне ва ўсходнім фасадзе і ў аб'ёмы, якія на паўночным фасадзе атачаюць прышчэпкі, унутры якіх знаходзіцца так званая капліца Каначы.Наступныя дэкаратыўныя і рэканструкцыйныя працы былі зафіксаваны паміж XV і XVI стагоддзямі, калі прысутнасць брацтваў (такіх як так званыя dei Battuti або Disciplini) спрыяла працы рабочых з Ламбардыі, якім мы абавязаны, напрыклад, упрыгожваннем скляпенне справа (завершана ў 1545 г. ланцам Рока дэ Рэдзісам) і рэалізацыя ганка (пабудаваны ў 1524 г. і завершаны фрэскамі ў 1533 г. Сімонай дэ Башэні з Аверы).
