Сабор Святога Марціна ў Айзенштаце ўпершыню згадваецца ў 1264 годзе. Ад гэтай капліцы да гэтага часу захаваліся рэшткі раманскага падмурка ў раёне цяперашняга хору. У 13 стагоддзі капліца была пашырана за кошт дадання раннеготического хору. У 14 стагоддзі была прыбудаваная капліца для вернікаў. У 1460 годзе царква была перабудавана пад кіраўніцтвам ГАРАДСКОГА капітана Іагана Зибенхиртера як умацаваная або абарончая царква, паколькі чакалася напад туркаў пасля падзення Канстанцінопаля ў 1453 годзе. Гатычную будынак было скончана ў 1522 годзе. Пасля вялікага пажару 1589 года прайшло амаль 30 гадоў, перш чым пачалося будаўніцтва моцна пацярпелай царквы, паміж 1610 і 1629 гадамі.
У 1777 годзе быў дададзены вялікі алтар працы Стэфана Дорфмайстара, які паказвае "ператварэньне Святога Марціна". У наступным годзе Венскі органщик Маллек устанавіў орган па ўказанні Ёзэфа Гайдна.
Пасля стварэння епархіі Айзенштата ў 1960 годзе царква Святога Марціна была ўзведзена ў ранг кафедральнага сабора. Святы Марцін стаў апекуном дыяцэзіі і Краіны. Пры біскупе Стэфане Ласла ў 1960 годзе інтэр'ер і вокны былі абноўленыя.
Сабор славіцца сваёй царкоўнай музыкай. Тут таксама праходзяць канцэрты штогадовага фестывалю Гайдна. У 2002/2003 гадах сабор быў зноў адрэстаўраваны, інтэр'ер абноўлены. Сучасная мэбля была распрацавана мастачкай Брыджыт Кованц.
