Тункинский Нацыянальны парк характарызуецца гарыстым і моцна паламаным рэльефам. Галоўная водная артэрыя парку-рака Іркут з некалькімі прытокамі. Расліннасць парку прадстаўлена горна-лугавымі, горна-тундравымі, тайговымі і горна-тайговымі супольнасцямі. Флора гэтага рэгіёну надзвычай разнастайная. На тэрыторыі Тункинского парку расце больш 900 відаў сасудзістых раслін, найбольш шматлікімі з якіх з'яўляюцца лугавыя і лясныя планты.
Фауна парку таксама даволі разнастайная. Тут жыве больш за 40 відаў жывёл. З буйных і сярэдніх прадстаўнікоў фауны варта вылучыць: вавёрку-ляцягу, вавёрку-даўгахвостка, собаля, тхара стэпавага, ласку, лася, зайца, бурундука, андатру, барсука, гарнастая, бурага мядзведзя, аленя, казулю, дзіка, кабаргу і гэтак далей.
На тэрыторыі нацыянальнага парку размешчана мноства дзіўных помнікаў прыроды, напрыклад: "Мармуровае дно", Выток" Хонгор-Уула", маляўнічае"Хобокское возера".