Тункинский национальный парк характеризуется гористым и сильно изломанным рельефом. Главная водная артерия парка-река Иркут с несколькими притоками. Растительность парка представлена горно-луговыми, горно-тундровыми, таежными и горно-таежными сообществами. Флора этого региона чрезвычайно разнообразна. На территории Тункинского парка произрастает более 900 видов сосудистых растений, наиболее многочисленными из которых являются луговые и лесные планты.
Фауна парка также довольно разнообразна. Здесь обитает более 40 видов животных. Из крупных и средних представителей фауны следует выделить: белку-летягу, белку-длиннохвостку, соболя, хорька степного, ласку, лося, зайца, бурундука, ондатру, барсука, горностая, бурого медведя, оленя, косулю, кабана, кабаргу и так далее.
На территории национального парка расположено множество удивительных памятников природы, например: “Мраморное дно”, Исток “Хонгор-Уула”, живописное “Хобокское озеро”.