Тункинський Національний парк характеризується гористим і сильно зламаним рельєфом. Головна водна артерія парку-Річка Іркут з декількома притоками. Рослинність парку представлена гірничо-луговими, гірничо-тундровими, тайговими і гірничо-тайговими спільнотами. Флора цього регіону надзвичайно різноманітна. На території Тункінського парку росте понад 900 видів судинних рослин, найбільш численними з яких є лугові та лісові Планти.
Фауна парку також досить різноманітна. Тут мешкає понад 40 видів тварин. З великих і середніх представників фауни слід виділити: Білку-летягу, білку-довгохвостку, соболя, тхора степового, ласку, лося, зайця, бурундука, ондатру, борсука, горностая, бурого ведмедя, оленя, козулю, кабана, кабаргу і так далі.
На території Національного парку розташовано безліч дивовижних пам'яток природи, наприклад:" Мармурове дно", витік" Хонгор-Уула", мальовниче"Хобокское озеро".