מיליוני מדוזות זהובות הנמצאות באגם מדוזה הן תת-מין ייחודי הקרוי על שמו של הנשיא לשעבר נגיראטקל אטפיסון. תת-מין זה נמצא רק באגם הימי הזה, ובשום מקום אחר בעולם. אגם מדוזה הוא אחד האגמים הימיים המבודדים (מארומיקטיק). שפת האגמים מרופדת בעצי מנגרוב ושורשיהם מכוסים במגוון צבעוני של חסרי חוליות ימיים. אגם המדוזות הוא אורכו 400 מטר ועומקו 30 מטר. בין 13 ל-15 מטר, ישנה שכבה ורודה של חיידקים ומתחת לזה, אין אור ואין חמצן. שכבת המים התחתונה מלאה בגז מימן גופרתי מומס רעיל. לאגם יש קשרים עקיפים רבים ללגונה וגובה הגאות והנפילה מתעכב בשעתיים (בהשוואה ללגונה). טווח הגאות הוא 45% מזה בלגונה (2 מטרים), או 0.8 מטרים. למדוזת הזהב יש זואנטלה, אצות סימביוטיות (dinoflagellates), שחיו ברקמותיהם. למדוזות ולאצות יש מערכת יחסים מיוחדת ומועילה. המדוזות מסתובבות ושוחות סביב האגם כדי להבטיח שהאצות יקבלו מספיק אור שמש לפוטוסינתזה, והאצות מעניקות למדוזות אנרגיה וחומרים מזינים בתמורה. בדרך כלל יש באגם כ-5 מיליון מדוזות מוזהבות.
