ידוע בשל מאמצי השימור שלה, גן החיות של סן דייגו מחזיק במספר מוצגים של מינים בסכנת הכחדה ועובד עם קבוצות שימור ברחבי העולם כדי לעודד הגנה על חיות בר מאוימות. לשמורה העצומה יש מסלולי הליכה נופים ומטיילים מסופרים באוטובוס. שביל הקופים בלב גן החיות כולל יערות אסיאתיים ואפריקאים עם יותר מ-30 מינים של ציפורים אקזוטיות, יונקים, זוחלים ודו-חיים. ב "טייגר ריבר", עקבות מעורפלים רוח בין מפלים ביער טרופי של יותר מ-5,000 סוגים של צמחים אקזוטיים ונמרים, פיתון בורמזי וטפירים מלזיים. התערוכה הפופולרית ביותר היא תחנת המחקר הענק Pacific Bell Panda, שבה מספר פנדות בסכנת הכחדה הולידו. דובי הפנדה הם להיט גדול וקווים ארוכים נוצרים לעתים קרובות במתחם. גן החיות מארח כמה מ-quot; לאחר dark "אירועים, כולל הופעות חיות ומפגשים עם חיות מקרוב.
