ARQUA הוא אסמכתא חיונית לגילוי המורשת התת-ימית הספרדית בשני אזורים נהדרים. הראשון, "מורשת תרבות תת-ימית", המתמקד בהסבר המתודולוגיה הנהוגה בחפירות תת-מימיות.שני המבנים למבנה מודרני מרשים, מקושר מתחת לפני הקרקע ונועד ליצור אפקט תת-מימי. בפנים, החלל המדהים הזה מכיל תערוכות המסבירות את התהליך המרתק של הארכיאולוגיה התת-ימית עצמה, ואוסף אקלקטי של חפצים הקשורים לספינות היסטוריות ששימשו בסחר הימי הקדום בים התיכון.תכונה מעניינת היא העתק של אחת הספינות הפיניקיות (המאה השביעית לספירה), שנמצאה במזרון. האזור השני, המכונה "Mare Hibericum", מזמין את המבקרים לגלות את חצי האי האיברי דרך ההיסטוריה המסחרית הדינמית של הים התיכון, מהעת העתיקה ועד למאה ה-19.יש גם חטי פיל מהתקופה הפיניקית, שהתגלו באתר Bajo de la Campana. זהו המוזיאון הראשון לארכיאולוגיה תת-ימית בספרד.חלק מהמאפיינים הטובים ביותר הם חתכים משוחזרים של ספינות המראים כיצד נבנו הכלים וכיצד אוחסנו מטענים. ישנן כמה דיורמות מיניאטוריות מפורטות מאוד המציגות סצנות של פעילות נמל ודגמי ספינות מתקופות שונות.התצוגה האחרונה היא על הפריגטה הספרדית Nuestra Senora de las Mercedes, שטבעה מול פורטוגל בשנת 1804. ההריסה הולידה תיק משפטי חשוב בין ממשלת ספרד לחברת ציד האוצרות Odyssy Marine Exploration, שהביא להחזר של כ-500 מיליון דולר בשווי של חפצים שנגזלו לספרד, כולל שפע של מטבעות ספרדיים מסורתיים המוצגים במוזיאון.
