בתקופה הרומית היה האי פאטמוס מקום של גלות ותלמידו של ישו, יוחנן הקדוש בשנת 95 לספירה היה על האי כי נידון לגלות במשך שנתיים. פאטמוס למעשה מוזכר במפורש ביצירה כמקום שבו היו לו החזיונות שלו וכתב את ההתגלות, האחרונה מתוך 27 הספרים של הברית החדשה. המערה של סנט אן, שבה זה יתקיים נחשב לאחד המקומות החשובים ביותר בעולם הנוצרי. ומסיבה זו פטמוס, נקרא "ירושלים של הים התיכון". המנזר נוסד על ידי כריסטופר הקדוש במהלך התקופה הערבית, במאה ה-XI ולאחר מכן נקרא על שמו של יוחנן תיאולוג. פטמוס היה כמעט נטוש כאשר נזיר מחונן ומשכיל זה, סן קריסטודולו בשנת 1088 ביקש וקיבל את ניהול האי כולו מהקיסר הביזנטי אלכסיוס הראשון קומננוס, להקים מנזר לכבודו של יוחנן הקדוש האוונגליסט. סן קריסטודולו נשארה בפטמוס עד 1108, אז נאלץ לנטוש אותה בשל פלישות שודדי ים טורקיים ונפטרה באותה שנה ביובואה. עם זאת, חלומו המשיך לעורר השראה בנזירים אחרים שהמשיכו בעבודתו במאות הבאות והרחיבו את המנזר בין המאות החמש עשרה והשבע עשרה. הקמתו של מנזר סנט ג ' ון תיאולוג סימנה את תחילתו של נתיב תרבותי ודתי שהוביל את האי להיות נקודת התייחסות לכל הנצרות. מאותו רגע החלה התפתחות מדהימה על האי פאטמוס, לא רק מנקודת המבט התרבותית, אלא גם מן הכלכלי. במשך מאות שנים, כמעט באלף היסטוריה המנזר של סן ג ' ובאני נשאר תמיד פעיל ומשמר ציורי קיר ומסמכים עתיקים בעלי ערך רב. האי פאטמוס הוכרז קדוש על ידי הפטריארכיה, חוק סינוד והחוק 1155/81 של המדינה היוונית. המנזר יחד עם העיר צ 'ורה ומערת האפוקליפסה נקראו על ידי אתר מורשת עולמית של אונסק" ו ב-1999, בשל ערכם האוניברסלי הגבוה. המנזר, שנראה מבחוץ, נראה כמו מבצר בשל הקירות המרשימים שלו בגובה 15 מטרים. הוא נבנה על פסגת פטמוס הגבוהה ביותר עם הרעיון לבנות מקום שניתן להגן עליו היטב מפיראטים. עם מותו של הנזיר, בניית הקירות החיצוניים האדירים של הכנסייה הראשית (מה שמכונה קתוליקון) של חדר האוכל וכמה מעשרים התאים הזמינים לנזירים היום הושלמו. בחלק הפנימי של המנזר יש חצרות רבות, קלויסטרים ו-10 קפלות. בחצר המרכזית, עם שלוש קשתות גדולות שנבנו בשנת 1698, יש את הקתוליקון, שנוסדה על ידי הכנסייה הראשית, הקפלה של סנט קריסטודולו ושל הבתולה. הקפלה המוקדשת לבתולה יש תוכנית מלבנית ובתי ציורי הקיר העתיקים ביותר של המנזר, שראשיתה בסוף המאה ה XI. בתוך הכנסייה, עם תוכנית צלב יוונית וכיפה מרכזית, יש איקונוסטזיס של 1820 וכמה ציורי קיר של המאה השבע עשרה.